尖銳濕疣常需與生殖器癌、扁平濕疣、假性濕疣、生殖器鮑溫樣丘疹病及珍珠樣丘疹病鑒別。 　　(1)生殖器部位癌　皮損較硬，邊界不清，鱗狀上皮瘤有明顯的向深部浸潤(rùn)，常形成潰瘍，有時(shí)應(yīng)進(jìn)行病理組織學(xué)檢查。尖銳濕疣一般呈乳頭狀生長(zhǎng)，病變淺表，很少浸潤(rùn)面。 　　(2)扁平濕疣　為梅毒二期皮疹。扁平濕疣多發(fā)生于肛周及外生殖器周圍，基底寬，無(wú)蒂，外觀扁平，疣面潮濕、光滑。暗視野顯微鏡檢查可找到梅毒螺旋體，梅毒血清反應(yīng)為陽(yáng)性。詳見(jiàn)梅毒部分。 　　(3)假性濕疣　又稱女性絨毛狀小陰唇，在成年女性的小陰唇內(nèi)側(cè)上出現(xiàn)魚卵狀或細(xì)小絨毛狀、排列規(guī)則的增生物，互不融合，長(zhǎng)期不變，醋酸白試驗(yàn)陰性。 　　(4)生殖器鮑溫樣丘疹病　本病較少見(jiàn)，主要與人類乳頭瘤病毒16型感染有關(guān)。表現(xiàn)為生殖器部位多發(fā)性棕紅色小丘疹，直徑2～10mm。臨床上很像尖銳濕疣，但組織學(xué)上類似鮑溫病的改變。作出這一診斷必須是專科醫(yī)師。 　　(5)珍珠樣丘疹病　發(fā)生于男性的龜頭，沿龜頭冠狀溝有排列整齊的大小一致的珍珠樣丘疹。米粒大小、圓頂、平滑，互不融合，長(zhǎng)期不變。 　　(6)皮脂腺異位癥：丘疹在粘膜內(nèi)無(wú)重疊生長(zhǎng)，多為淡黃色。 　　(7)傳染性軟疣：?jiǎn)蝹�(gè)不融合的皮色半球形丘疹，周圍光滑，中央可擠出軟疣小體。 　　(8)軟下疳：外生殖器皮膚損害為不規(guī)則形潰瘍，伴痛性橫痃。潰瘍面滲出物涂片可能查到杜克雷桿菌。 　　尖銳濕疣的診斷辨認(rèn)多靠醫(yī)生的臨床經(jīng)驗(yàn)，但由于性病在我國(guó)絕跡多年，臨床醫(yī)生的經(jīng)驗(yàn)有限，難免有判斷失誤的情況，據(jù)報(bào)告有些基層醫(yī)院的誤診率可達(dá)５０－８０％；尖銳濕疣多位于大小陰唇內(nèi)側(cè)、陰道口及肛門部位，病變呈淡紅、鮮紅或暗紅色米粒大或豆粒大突起的疣狀增生物，疣體濕潤(rùn)、柔軟，可單個(gè)或多個(gè)并存，有時(shí)呈菜花樣典型皮損。與尖銳濕疣相類似的疾患還有假性濕疣或絨毛狀小陰唇，后者多見(jiàn)于小陰唇內(nèi)下側(cè)，刺狀突出物與陰唇顏色相仿，狀似天鵝絨一般，但病人多無(wú)癥狀，只是白帶增多。其他容易誤診的還有處女膜贅狀物、扁平濕疣（二期梅毒疹）、皮脂腺增生等。 　　要準(zhǔn)確辨別這幾種不同疾患，十分實(shí)用而簡(jiǎn)便的辦法就是醋白試驗(yàn)，即用５％冰醋酸液涂在病變部位，３分鐘后疣體發(fā)白者為尖銳濕疣，否則另當(dāng)別論。或以浸有3—5％冰醋酸溶液的紗布包在可疑病變處3—5分鐘，若患處變白，則說(shuō)明是亞臨床感染。 　　還可以做碘黃試驗(yàn)，即用魯戈氏液涂后３分鐘，發(fā)黃者可以確診為尖銳濕疣。當(dāng)然更可靠的辦法是做組織病理學(xué)檢查。近兩年，國(guó)內(nèi)雜志已有多篇報(bào)告談到假性濕疣的鑒別診斷問(wèn)題，特別提到醋白試驗(yàn)。但組織病理學(xué)檢查的診斷也并非易事，有時(shí)也很難確診，仍然有賴于檢驗(yàn)者的業(yè)務(wù)水平和經(jīng)驗(yàn)。本病的明確診斷有賴于有效的病毒培養(yǎng)系統(tǒng)的建立、組織免疫化學(xué)和分子生物工程技術(shù)ＤＮＡ探針的發(fā)展，那時(shí)就不會(huì)把假性濕疣擴(kuò)大化，誤診為尖銳濕疣了。 　　發(fā)生于陰道或?qū)m頸內(nèi)的濕疣可能不大明顯，且變化多端，僅靠臨床檢查，可能誤診，常需做細(xì)胞學(xué)、陰道鏡及組織病理學(xué)檢查。 　　a.細(xì)胞學(xué)檢查：用陰道或?qū)m頸濕疣組織涂片作巴氏染色，若發(fā)現(xiàn)角化不良細(xì)胞和空泡細(xì)胞混合存在，對(duì)本病有診斷價(jià)值。 　　b.免疫組織化學(xué)檢查：過(guò)氧化酶-抗過(guò)氧化酶抗體復(fù)合技術(shù)（即PAP法）是一種免疫學(xué)方法，采用特異性HPV的抗血清用來(lái)顯示病毒蛋白，籍此證明濕疣中的病毒抗原，較常規(guī)電鏡方法更為迅速、有效。 　　病理檢查有助于診斷，經(jīng)棘細(xì)胞中上層出現(xiàn)空泡細(xì)胞最具診斷意義。 　　多聚酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)等分子生物學(xué)技術(shù)檢測(cè)HPV，此法還可用作亞型測(cè)定。但國(guó)內(nèi)大多數(shù)醫(yī)療機(jī)構(gòu)的PCR實(shí)驗(yàn)由于條件不足，誤診現(xiàn)象太多，已經(jīng)不足以作為診斷工具。現(xiàn)gopla正試圖采用基因芯片技術(shù)診斷尖銳濕疣，但由于成本仍高，并且依賴PCR將結(jié)果放大，只適用于實(shí)驗(yàn)室研究，在近年難以推廣。